太仆王允迁任尚书令，以司徒黄琬为太尉，司空杨彪为司徒，光禄勋荀爽为司空。
尚书周毖和城门校尉伍琼深受董卓信任，此前他们以袁氏树恩四世门生故吏遍于天下为由，劝阻董卓赦免了袁绍，拜为勃海太守，又封袁绍邟乡侯。
此时他们又向董卓推荐韩馥、刘岱、孔伷、张咨、张邈等人，董卓将这些人封为州郡长官：以尚书韩馥为冀州牧，侍中刘岱为兖州刺史，陈留孔伷为豫州刺史，东平张邈为陈留太守，颍川张咨为南阳太守。
谁也想不到，才过一个多月，190年正月，一些关东诸州郡牧守起兵，讨伐董卓。
北方，推渤海郡太守袁绍为盟主，冀州牧韩馥、兖州刺史刘岱、豫州刺史孔伷、陈留太守张邈等都于此时参加讨卓。
诸州郡牧守各拥兵数万，袁绍自号车骑将军，与河内太守王匡屯于河内；韩馥屯于邺城，孔伷屯于颍川。刘岱、张邈、东郡太守桥琩，山阳太守袁遗、济北相鲍信、奋武将军曹操等屯于酸枣；南方，长沙太守孙坚也起兵北上，和后将军袁术在鲁阳结盟讨董。
由于讨伐董卓的众诸侯都不承认董卓所立的伪帝刘协，于是董卓派李儒逼死了废帝刘辩。
如此一来，刘协就成了先皇刘宏的唯一子嗣，各路诸侯想不承认都没有办法。
董卓如今朝中众臣商议出兵讨伐关东联军之事，尚书郑泰担心董卓军队兵多，强悍难制，于是出言反对出兵，引起董卓的不悦，郑泰再三解释才让董卓听从他的建议，一度让他统率诸军对抗诸侯联军。
之后，李儒劝董卓说郑泰智略过人，其实暗中与敌人合谋，给他兵马就是让他交给各路诸侯。董卓于是收回郑泰兵权，改拜郑泰为议郎。
经过韦尤两三个月的医治，董白已经能够勉强的开口说话，虽然还不太利索，可是也令董卓惊喜交集，想也不想就答应了韦尤收原来万年公主身边两个宫女作为侍女的小小要求。
最危险的地方往往是最安全的地方，韦尤担心刘芊出意外，干脆就将她和玉儿要到了身边作贴身侍女，谁也想不到假装已死的刘芊会隐藏在相国府里。
刘芊听说各路诸侯纷纷起兵讨伐董卓，又混到韦尤的身边，自然是喜出望外，对他的话更是言听计从。
同年二月，董卓见关东联军兵力强盛，又担心郭太率十几万白波军趁势夹击，而且董卓军队的精锐是凉州兵，西凉兵恋家情结重，若西返凉州的交通线被切断，必然会导致军心大乱，那时将会不战自败，想要迁都长安暂避。
朝廷公卿都不愿意迁都，却没有人敢出面反对，董卓表河南尹朱俊为太仆以为副相国，朱俊坚辞不肯接受。
董卓随后召集朝廷公卿商议迁都之事，遭到太尉黄琬、司徒杨彪的一致反对，司空荀爽担心董卓加害两人，连忙在旁边劝解开来。
不久，董卓以灾异奏免黄琬、杨彪等人的职位，以光禄勋赵谦为太尉，太仆王允为司徒。
城门校尉伍琼、督军校尉周毖顽固的谏阻迁都，引得董卓大怒，之前两人所举荐州郡长官的人像韩馥、刘岱、孔伷、张咨、张邈等人竟然全部都起兵来讨伐他，董卓认为周毖、伍琼与他们串通勾结，于是杀了二人。
黄琬、杨彪深感恐惧，去相国府谢罪，董卓也有点后悔杀了周毖、伍琼两人，于是又上表黄琬、杨彪为光禄大夫。